本文簡述菇類的野外拍照、採集方法及室內巨觀描述，接著進入研究室，經由顯微觀察子實層內的孢子、擔子、囊狀體、菌絲等構造，以及如何將菇菇做分類。原來看似小巧的菇類中蘊藏著許多細節，帶大家一同領會菇菇令人著迷之處。

植物和真菌在生態系中分別扮演生產者與分解者的角色，從生態系平衡的角度來看，兩者缺一不可，而植物與真菌之間有著非常緊密的共生關係，這與植物登陸的演化史有關，也影響植物在乾旱等逆境時的生存能力。然而，並非所有真菌對植物都有所助益。

真菌命名受「國際藻類、真菌及植物命名法規」的規範。世界上的生物每一種只能允許有一個合法的拉丁學名。幾種重要食、藥用真菌的拉丁學名在近十多年來有所改變，主要原因是發現跟過去所使用的學名是不同的種類，或是種的屬名改了。本文說明靈芝、樟芝、桑黃、黑木耳及冬蟲夏草的學名改變緣由。