隨著史前人類進入新石器時代，人畜共存使得傳染病發生的頻率變多。針對史前流行病的判斷較為困難，以往學者只能從已發掘的考古遺址，特別針對出土遺跡和墓葬異常的現象判斷。近年來科學技術如DNA檢驗的快速發展，讓科學家也可以從人類遺骸中獲取古代傳染病的病原體基因組，這提供新管道讓人們能從實證的角度探究古代傳染病的起源與傳播。