1996年業餘考古家黃炫星老師在埔里一帶進行鳥類觀察時，於水蛙窟遺址發現農民因種植生薑、雇用怪手整地，挖出寬廣的斷面，並暴露出殘斷的石棺，當時在翻起的土中曾發現不少史前捕魚用的網墜及玉錛等珍貴遺物。